Konfigurace obsahuje parametry, které ovlivňují způsob fungování podsystému Mzdy a nejsou přímo spojeny s jednotlivými mzdovými složkami. Tyto parametry jsou rozděleny do skupin a uspořádány na obrazovkách, které jsou označeny písmeny. Tyto parametry se nastavují vždy při náběhu podsystému Mzdy, dále při legislativních změnách nebo při jiných změnách ovlivňujících výpočet mezd v organizaci. Za správnost nastavení těchto parametrů zodpovídá uživatel.